常见的水仙花病虫害有大褐斑病、腐烂病、线虫病、水仙蝇、刺足根螨等：

约在3-5月份病发，最好每隔1-2周喷杀一次，喷杀时使用75%百菌清700倍液，需要将种球放于清水中进行浸泡1小时左右，最后再于贡水中浸泡30分钟左右即可播种。

这两种病状是水仙最重要的病害之一，植株在感染病害后，表面上看起来鳞茎完好无损，但是其内部却早已损坏或腐烂，及时将腐烂的病部去除干净，图上保护性的药剂，需要及时对土壤进行消毒，以防止腐烂病和线虫病。

刺足根螨白色发亮，提醒与成螨相似，颗体和足色较浅，酮体呈白色，可以使用40%三氯杀螨醇1000倍药液等进行喷杀。

水仙蝇产卵与土壤，孵出来的幼虫侵入球体，使鳞茎球腐烂变黑。对付水仙蝇就需要使用二硫化碳了，要在生长期对水仙花进行浇灌。